教授温州医科大学检验医学院
教师简介

包其郁,教授,博士生导师,享受国务院政府特殊津贴。现从事《微生物学》、《基因组生物信息学》、《生物化学》、《分子生物学检验技术》的教学和科研工作。2002年在中科院遗传与发育生物学研究所获博士学位,参加了“人类基因组计划”和“水稻基因组计划”,为第一作者完成了“腾冲嗜热厌氧菌全基因组分析”,该研究为国内首次获得了一张原核生物全基因组序列图谱,填补了我国在此研究领域的空白。两度赴美国和英国访问;曾主持国家自然科学基金项目和省级科研基金项目各两项;发表SCI收录论著20多篇;先后获“中国科学院院长特别奖”、浙江省科技进步奖(三等奖3项)。

 

学习经历

1987.8-1990.7:在福建医科大学基因工程研究室获硕士学位, 1999.8-2002.7:在中国科学院遗传与发育生物学研究所获遗传学、

基因组学博士学位。

教学工作经历

1990-现在:温州医学院,教授,进行基因组信息学、微生物学、生物化学教学和研究工作。

科研经历

1990-现在: 温州医学院,教授,博士生导师,耐药性机理的宏基因组研究,螺旋藻全基因组分析和功能基因组研究,苏云杆菌的功能基因组研究。

2009.2-2009.8:美国佛罗里达大学,微生物遗传学研究,访问学者。

2002.8-2008:杭州华大基因研发中心客座教授,猪霍乱沙门氏菌全基因组分析、苏云杆菌基因组全序列分析,SARS病毒遗传变异研究。

1999.8-2002.7:中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心,攻读博士学位,在读期间,先后参与人类基因组计划1%项目,水稻基因组计划,具体负责腾冲嗜热厌氧菌全基因组测序分析研究。

1998.7-1998.12: 上海血液研究所,从事基因的克隆与表达研究;

2002.1-2002.6: 英国牛津大学生物化学系,从事群体遗传学研究。

承担课题

1. 高通量测序分析病原菌质粒携带的耐药新基因, 81171614, 国家自然科学基金项目,2012.1-2015.12,第二。

2.人体内和细胞传代培养SARS病毒基因组的遗传变异研究,C011003,国家自然科学基金项目,2007.1-2007.12,项目负责人,已结题。

3.    螺旋藻全基因生物信息分析,30571009,国家自然科学基金项目,2006.1-2008.12,项目负责人。

4.    农业微生物杀虫防病功能基因的发掘和分子机理研究,2003CB114200,国家973计划课题,2004.11-2008.12,第二。

5.    螺旋藻功能基因组及抗盐碱功能相关基因的研究,浙江省自然科学基金,2008.1-2010.12,项目负责人。

6.    疾病相关细菌耐药性基因检测芯片的制备,浙江省科技厅,2008.1-2010.12, 项目负责人。

 

获奖

1. 中国科学院院长特别奖,中国科学院,2002.12,第一

2.温州地区小二喉乳头状瘤病因学及临床治疗研究,浙江省科学技术进步奖三等奖,证书编号:05032562005.12, 第二。

3.肝病实验诊断项目分类方法的研究,浙江省科学技术进步奖三等奖,证书编号:0203113-22002.12,第二。

4.小儿腹泻病原及其分子生物学研究,浙江省科学技术进步奖三等奖,证书编号:9942531999.12,第一。

 

发表的部分文章:

 

1. Qiyu Bao, Yuqing Tian, Wei Li, Huanming Yanget al. A Complete                   Sequence of the T.tengcongensis Genome. Genome Research, 2002125):689700. SCIIF10.1

2. Xu T, Ying J, Yao X, Song Y, Ma P, Bao B, Jiang W, Wu X, Tou H, Li P, Ren P, Fei J, Yang L, Liu Q, Xu Z, Zhou T, Ni L, Bao Q. Identification and Characterization of Two Novel bla(KLUC) Resistance Genes through Large-Scale Resistance Plasmids Sequencing. PLoS One. 2012; 7(10):e47197. doi: 10.1371/journal.pone.0047197.

3.  Peizhen Li, Biaobang Chen, Zhijian Song, Yulong Song, Yanmei Yang, Ping Ma, Huifeng Wang, Jun Ying, Ping Ren, Lei Yang, Guohui Gao, Shouguang Jin, Qiyu Bao*, Hongjiang Yang*. Bioinformatic analysis of the Acinetobacter baumannii phage AB1 genome. Gene,  2012, 507: 125-134.

4.  Linsheng Yu, Jipu Yi, Guanghua Ye, Yuanyuan Zheng, Zhijian Song, Yanmei Yang, Yulong Song, Zhenyuan Wang, Qiyu Bao*. Effects of curcumin on levels of nitric oxide synthase and AQP-4 in a rat model of hypoxia–ischemic brain damage. brain research, 2012, 1475: 88–95.

5. Gong Y, Li M, Xu D, Wang H, He J, Wu D, Chen D, Qiu N, Bao Q, Sun M, Yu Z. Comparative proteomic analysis revealed metabolic changes and the translational regulation of Cry protein synthesis in Bacillus thuringiensis. J Proteomics. 2012 Feb 2; 75(4):1235-46.

6.  Du J, Chen C, Ding B, Tu J, Qin Z, Parsons C, Salgado C, Cai Q, Song Y, Bao Q, Zhang L, Pan J, Wang L, Yu F.  Molecular Characterization and Antimicrobial Susceptibility of Nasal Staphylococcus aureus Isolates from a Chinese Medical College Campus. PLoS One. 2011; 6(11):e27328.

7.  Yu T, Li J, Yang Y, Qi L, Chen B, Zhao F, Bao Q*, Wu J. Codon usage patterns and adaptive evolution of marine unicellular cyanobacteria Synechococcus and Prochlorococcus. Mol Phylogenet Evol. 2012 Jan; 62(1):206-13. (SCIIF3.9并列通讯作者)

8. Zhou TL, Chen XJ, Zhou MM, Zhao YJ, Luo XH, Bao QY. Prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance in Escherichia coli isolates in Wenzhou, Southern China, 2002-2008. Jpn J Infect Dis. 2011, 64(1):55-7.  SCI

9.  Zhang, Y*, Bao Q*, Gagnon LA, Huletsky A, Oliver A, Jin S, Langaee T. ampG gene of Pseudomonas aeruginosa and its role in {beta}-lactamase expression.  Antimicro and Chemotherapy . 2010 Nov;54(11):4772-9. (SCIIF4.7,* 并列第一作者)