主要讲授《地质学基础》、《构造地质学》等室内课程，承担武汉周边地质实习、秭归地质教学实习、周口店野外教学实习。出版《地质学基础实习指导书》。

    主要研究方向为大地构造学、盆-山相互作用，目前科研兴趣集中在：1. 北祁连加里东造山带盆山相互作用过程；2. 华南加里东期（广西运动）造山作用的成因、构造 - 沉积演化研究。目前承担国际自然科学基金青年基金: 北祁连加里东造山带的初始碰撞与同造山盆地转换（2011-2013）、中央高校基金“摇篮计划”：钦防构造带早古生代造山作用的沉积响应(2012-2014)。2009 年 9 月 -2009 年 12 月赴澳大利亚西澳大学（ University of Western Australia ）访问研究。

    已发表代表性论文：

    1.Xu Y J, et al. 2012. Detrital zircon provenance of Upper Ordovician and Silurian strata in the northeastern Yangtze Block: Response to orogenesis in South China. Sedimentary Geology, (267-268):63-72

    2.Xu Y J, Du Y S, Huang H W, et al. Detrital zircon of 4.1 Ga in South China. Chin Sci Bull, 2012, 57:1-7, doi: 10.1007/s11434-012-5465-8 

    3.Xu Y J, et al. 2010. Detrital zircon record of continental collision: Assembly of the Qilian Orogen, China. Sedimentary Geology. 230(1-2), 35-45.

    4.Xu Y J, et al. 2010. Provenance record of a foreland basin: Detrital zircon U–Pb ages from Devonian strata in the North Qilian Orogenic Belt, China. Tectonophysics, 495, 337–347.

    5.Xu Y J, et al. 2010. Sedimentary Geochemistry and provenance of the Lower and Middle Devonian Laojunshan Formation, the North Qilian Orogenic Belt. Science in China Series D: Earth Sciences 53(3), 2010, 356-367

    6.徐亚军等. 2011，甘肃靖远上泥盆统沙流水组沉积地球化特征及其物源分析, 沉积学报, 29（1）: 41-54.

    7.徐亚军等.2011，北祁连造山带东段上奥陶统中泥盆统砂岩碎屑组分与物源分析, 地质科技情报, 30（2）: 28-33.

    8.徐亚军等. 2005.秦岭地区城口-房县断裂带变形特征及ESR定年. 现代地质, 19(1): 128-132.

    9.徐亚军等. 2007. 沉积物物源分析研究进展. 地质科技情报, 26(3):26-32.